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IDT NGS二代測序文庫構(gòu)建接頭
——UDI-UMI全長接頭、通用短Y型接頭、接頭引物


 
北京澤平代理的美國進口IDT NGS二代測序DNA文庫構(gòu)建接頭Adapter,提供即用型測序P5/P7全長接頭(UDI-UMI接頭)、通用短接頭(短Y型接頭)、測序接頭引物(Index引物),以及定制合成長、短接頭和接頭引物服務(wù),用于靈活滿足Illumina二代測序基因文庫建庫需求。

IDT NGS二代測序文庫構(gòu)建接頭 代理商北京澤平

 

應用 建議接頭 特點
無PCR全基因組測序(WGS) IDT xGen UDl-UMI全長接頭 無PCR的應用領(lǐng)域需要全長接頭
無PCR宏基因組學
無PCR測序(初始量≥100ng)
低水平突變檢測(低至約1%的頻率) 靈敏度更高,使用UMI一致性分析去除測序錯誤
以全長、雙鏈、初始cDNA開始RNA測序 更量化,去除PCR重復
甲基化測序 IDT xGen UDI-UMI 全長甲基化接頭,xGen短接頭加UDI引物對(甲基化接頭) 亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化需要甲基化胞嘧啶
全基因組測序(WGS) IDT xGen短接頭加UDI引物對 流程簡單,使用通用接頭制備連接預混合液,并通過PCR引入樣本標簽
宏基因組(初始量為1-250ng)
外顯子測序
生殖細胞系靶系列測序(SNP、插入缺失)


 


一、IDT xGen UDI-UMI全長接頭
 
二代測序文庫構(gòu)建接頭 IDT xGen UDI-UMI全長接頭 代理商北京澤平

即用型IDT xGen UDI-UMI全長接頭(完整Y型接頭),DNA添加接頭后無需進行PCR,可直接使用Illumina測序儀進行測序。IDT UDI-UMI全長接頭序列由與Illumina Flowcell表面oligo互補的P5和P7序列、用于區(qū)分不同文庫的序列特異雙端標簽(Unique Dual Index,UDI,即Barcode,含i5/i7 Index)、測序引物結(jié)合位點(Read 1 SP 和 Read 2 SP,即Rd1 SP 和Rd2 SP)、用于區(qū)分每一個DNA分子的唯一分子標簽(Unique Molecular Identifier, UMI)組成。

IDT UDI-UMI接頭整合了UDI接頭和UMI接頭優(yōu)勢,大大降低二代測序中的錯配風險,更適合于靈敏檢測需求。

IDT UDI序列特異雙端標簽(Unique Dual Index)在DNA片段兩端各添加唯一Index,通過交叉驗證Index,以區(qū)分不同文庫,減少Illumina二代測序時的標簽串擾和交叉污染問題,提高準確性。IDT Index標簽序列由8或10個堿基組成,提供1536種Index,兼容2色和4色Illumina測序儀。

IDT UMI唯一分子標簽(Unique Molecular Identifier)是短序列,在UDI基礎(chǔ)上,為文庫中的每個DNA片段上加入一個唯一的標記,使PCR擴增的序列具有相同的插入片段和UMI分子標簽,用于識別原始樣本中的等位基因突變是真實的低頻突變還是文庫PCR擴增或測序?qū)е碌腻e誤,提高突變檢測靈敏度。

 

 
二、IDT xGen 短接頭和接頭引物

二代測序文庫構(gòu)建接頭 IDT xGen 短接頭和接頭引物 代理商北京澤平

即用型IDT xGen 通用短接頭,為雙鏈體接頭(通用Y型接頭,短Y接頭),直接連接DNA片段后,需使用測序接頭引物(Index引物),如UDI雙端標簽引物、或CDI組合型雙標簽引物,通過PCR將Index序列、P5/P7序列添加到短接頭上。


 


三、IDT接頭和接頭引物定制合成服務(wù)

IDT提供定制合成服務(wù),包括可兼容Illumina TruSeq平臺、Nextera平臺的各類全長接頭、短Y接頭、Index接頭引物,支持定制單標簽(Single Index)、序列特異雙端標簽(Unique Dual Index, UDI)、組合型雙標簽(Combinatorial Dual Index, CDI)、含UMI的雙端標簽(UDI-UMI)的接頭或接頭引物。

同時,IDT提供定制合成甲基化接頭服務(wù),包括UDI-UMI全長甲基化接頭、短甲基化接頭和UDI引物對等,用于亞硫酸鹽測序(甲基化測序)。

二代測序文庫構(gòu)建接頭 IDT接頭和接頭引物定制合成服務(wù) 代理商北京澤平

 

 
北京澤平代理的IDT二代測序文庫接頭和引物

 

貨號 引物對數(shù)量 產(chǎn)品 特點
10006914 反應數(shù) 16 IDT xGen UDI-UMI全長接頭  
10005903 反應數(shù) 96
10005976 16 IDT xGen 通用短接頭和UDI引物 8nt
10005921 96 8nt
10005974   IDT xGen 通用短接頭  
10005924
10005975 16 IDT xGen UDI引物 8nt
10005922 96 8nt 1號96孔板
10009816 96 8nt 2號96孔板
10008052 384 10nt 1-4號96孔板
10008053 768 10nt 1-8號96孔板
10008054 1536 10nt 1-16號96孔板
10008055 384 10nt 1-4號96孔板,2 nmol
10008056 768 10nt 1-8號96孔板,2 nmol
10008057 1536 10nt 1~16號96孔板,2 nmol
10009815 96 IDT xGen CDI引物 8nt
定制   兼容TruSeq平臺的全長接頭 可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)、序列特異雙端標簽(UDI)或含UMI分子標簽的雙端標簽(UDI-UMI)。
定制   兼容TruSeq平臺的短接頭及標簽引物  可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)或序列特異雙端標簽(UDI)。
定制   兼容TruSeq平臺的標簽引物  可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)或序列特異雙端標簽(UDI)。
定制   兼容Nextera平臺的標簽引物  可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)或序列特異雙端標簽(UDI)。
定制   甲基化接頭和接頭引物 甲基化全長接頭、甲基化短接頭和接頭引物


 

 
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——IDT一級代理商,北京澤平

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