IDT NGS二代測序文庫構(gòu)建接頭
——UDI-UMI全長接頭、通用短Y型接頭、接頭引物
北京澤平代理的美國進口IDT NGS二代測序DNA文庫構(gòu)建接頭Adapter,提供即用型測序P5/P7全長接頭(UDI-UMI接頭)、通用短接頭(短Y型接頭)、測序接頭引物(Index引物),以及定制合成長、短接頭和接頭引物服務(wù),用于靈活滿足Illumina二代測序基因文庫建庫需求。
應用 |
建議接頭 |
特點 |
無PCR全基因組測序(WGS) |
IDT xGen UDl-UMI全長接頭 |
無PCR的應用領(lǐng)域需要全長接頭 |
無PCR宏基因組學 |
無PCR測序(初始量≥100ng) |
低水平突變檢測(低至約1%的頻率) |
靈敏度更高,使用UMI一致性分析去除測序錯誤 |
以全長、雙鏈、初始cDNA開始RNA測序 |
更量化,去除PCR重復 |
甲基化測序 |
IDT xGen UDI-UMI 全長甲基化接頭,xGen短接頭加UDI引物對(甲基化接頭) |
亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化需要甲基化胞嘧啶 |
全基因組測序(WGS) |
IDT xGen短接頭加UDI引物對 |
流程簡單,使用通用接頭制備連接預混合液,并通過PCR引入樣本標簽 |
宏基因組(初始量為1-250ng) |
外顯子測序 |
生殖細胞系靶系列測序(SNP、插入缺失) |
一、IDT xGen UDI-UMI全長接頭
即用型IDT xGen UDI-UMI全長接頭(完整Y型接頭),DNA添加接頭后無需進行PCR,可直接使用Illumina測序儀進行測序。IDT UDI-UMI全長接頭序列由與Illumina Flowcell表面oligo互補的P5和P7序列、用于區(qū)分不同文庫的序列特異雙端標簽(Unique Dual Index,UDI,即Barcode,含i5/i7 Index)、測序引物結(jié)合位點(Read 1 SP 和 Read 2 SP,即Rd1 SP 和Rd2 SP)、用于區(qū)分每一個DNA分子的唯一分子標簽(Unique Molecular Identifier, UMI)組成。
IDT UDI-UMI接頭整合了UDI接頭和UMI接頭優(yōu)勢,大大降低二代測序中的錯配風險,更適合于靈敏檢測需求。
IDT UDI序列特異雙端標簽(Unique Dual Index)在DNA片段兩端各添加唯一Index,通過交叉驗證Index,以區(qū)分不同文庫,減少Illumina二代測序時的標簽串擾和交叉污染問題,提高準確性。IDT Index標簽序列由8或10個堿基組成,提供1536種Index,兼容2色和4色Illumina測序儀。
IDT UMI唯一分子標簽(Unique Molecular Identifier)是短序列,在UDI基礎(chǔ)上,為文庫中的每個DNA片段上加入一個唯一的標記,使PCR擴增的序列具有相同的插入片段和UMI分子標簽,用于識別原始樣本中的等位基因突變是真實的低頻突變還是文庫PCR擴增或測序?qū)е碌腻e誤,提高突變檢測靈敏度。
二、IDT xGen 短接頭和接頭引物
即用型IDT xGen 通用短接頭,為雙鏈體接頭(通用Y型接頭,短Y接頭),直接連接DNA片段后,需使用測序接頭引物(Index引物),如UDI雙端標簽引物、或CDI組合型雙標簽引物,通過PCR將Index序列、P5/P7序列添加到短接頭上。
三、IDT接頭和接頭引物定制合成服務(wù)
IDT提供定制合成服務(wù),包括可兼容Illumina TruSeq平臺、Nextera平臺的各類全長接頭、短Y接頭、Index接頭引物,支持定制單標簽(Single Index)、序列特異雙端標簽(Unique Dual Index, UDI)、組合型雙標簽(Combinatorial Dual Index, CDI)、含UMI的雙端標簽(UDI-UMI)的接頭或接頭引物。
同時,IDT提供定制合成甲基化接頭服務(wù),包括UDI-UMI全長甲基化接頭、短甲基化接頭和UDI引物對等,用于亞硫酸鹽測序(甲基化測序)。
北京澤平代理的IDT二代測序文庫接頭和引物
貨號 |
引物對數(shù)量 |
產(chǎn)品 |
特點 |
10006914 |
反應數(shù) 16 |
IDT xGen UDI-UMI全長接頭 |
|
10005903 |
反應數(shù) 96 |
10005976 |
16 |
IDT xGen 通用短接頭和UDI引物 |
8nt |
10005921 |
96 |
8nt |
10005974 |
|
IDT xGen 通用短接頭 |
|
10005924 |
10005975 |
16 |
IDT xGen UDI引物 |
8nt |
10005922 |
96 |
8nt 1號96孔板 |
10009816 |
96 |
8nt 2號96孔板 |
10008052 |
384 |
10nt 1-4號96孔板 |
10008053 |
768 |
10nt 1-8號96孔板 |
10008054 |
1536 |
10nt 1-16號96孔板 |
10008055 |
384 |
10nt 1-4號96孔板,2 nmol |
10008056 |
768 |
10nt 1-8號96孔板,2 nmol |
10008057 |
1536 |
10nt 1~16號96孔板,2 nmol |
10009815 |
96 |
IDT xGen CDI引物 |
8nt |
定制 |
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兼容TruSeq平臺的全長接頭 |
可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)、序列特異雙端標簽(UDI)或含UMI分子標簽的雙端標簽(UDI-UMI)。 |
定制 |
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兼容TruSeq平臺的短接頭及標簽引物 |
可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)或序列特異雙端標簽(UDI)。 |
定制 |
|
兼容TruSeq平臺的標簽引物 |
可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)或序列特異雙端標簽(UDI)。 |
定制 |
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兼容Nextera平臺的標簽引物 |
可選配單標簽(Single Index)、組合型雙端標簽(CDI)或序列特異雙端標簽(UDI)。 |
定制 |
|
甲基化接頭和接頭引物 |
甲基化全長接頭、甲基化短接頭和接頭引物 |
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